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癌症新生抗原鉴定

人气:151发表时间:2021-04-02 17:21【

癌症新抗原鉴定

 
通过乳腺癌的基因组分析所证实癌症的突变景观是复杂的,黑色素瘤[,肝癌和许多其他主要的癌症类型。下一代测序(NGS)技术的进步已经实现了肿瘤序列与正常序列之间快速,经济高效的比较,这是癌症新抗原鉴定的起点(图1)。
 
图1新抗原疫苗的设计与制造
DNA测序检测到的许多体细胞突变均未表达(即非编码突变,无义突变或单等位基因表达)。对于那些表达的突变导致氨基酸序列改变,异常氨基酸序列必须成功翻译,然后加工成短肽片段,并在MHC分子的背景下展示在细胞表面上,以便被免疫系统识别。抗原的处理和呈递是一个复杂的过程,涉及多个步骤,可能会影响新抗原的呈递。MHC I类和II类分子的抗原加工过程不同。MHC I类分子呈现内源产生或由专业抗原呈递细胞获得的8-10个氨基酸肽。MHC II类分子呈现出更长的肽(11-20个氨基酸),这些肽来自外源蛋白质。因此,预测体细胞突变是否会产生新抗原取决于以下几个关键因素:(i)体细胞突变是否在蛋白质水平表达;(ii)突变蛋白是否可以天然加工成合适的肽用于呈递,( iii)突变体肽与患者自身MHC分子的结合亲和力;以及(iv)突变体肽/ MHC复合体与响应性T细胞的TCR的亲和力。更多内容请查看原文献
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